Cell | 染色质激活或抑制状态决定了核小体受控的差异性

2021-12-13 05:34:03 来源:
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肝细胞形态通过促进或可抑制该形态的转录可以控制突变物质组的机能和细胞身份认定。这些肝细胞形态当中存在特定的丝氨酸译成后形态上(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定转录平衡状态系统对性,并可促进可-HT染色体形态的呈现出,影响突变物质的隐含。为了在细胞器时依然保持突变物质隐含程序的完整性,同意肝细胞形态的分子特征也必需在子代细胞当中确立。确立相同类标准型肝细胞平衡状态的举足轻重同意因素是丝氨酸PTMs,主要存在于丝氨酸H3和H4的尾巴上。因此,在细胞器的过程当中,除了DNA粘贴,互补核小体也必需重建,并资源分配到子代细胞当中。或许,科学研究注意到互补的经典丝氨酸(比如粘贴依赖的丝氨酸)会在粘贴叉后促使再度组装。相同的科学研究小组注意到H3K9me3和H3K27me2/3可通过胚胎突变。然而,这两个丝氨酸形态上都是与可-HT肝细胞形态系统对性。那么,互补当中的核小体,以及它们携带的丝氨酸PTMs究竟都能突变到子代细胞不常为异的突变物质正当中央上呢?来自纽约大学兰戈恩医学当中心的Danny Reinberg教授课题组在Cell发表科学研究Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该科学研究注意到在DNA粘贴时,应答与受可抑制肝细胞地带的核小体分立是相同的。受可抑制肝细胞形态当中的核小见识被收容在子代细胞不常为异的突变物质地带,而应答标准型肝细胞形态当中的核小体的资源分配则是弥散和随机的。为科学研究核小体的分立情况下,科学界在候选突变物质正当中央不可逆的标示出丝氨酸H3.1和H3.2,以小鼠受精骨髓当中核小体在细胞器时的变化。比较简单来说,该方法通过邻近蛋白标示出技术,为了让CRISPR为特定突变物质正当中央的H3.1和H3.2带上谷氨酸标示出,经ChIP-qPCR验证该谷氨酸标示出在基因表达G1期和S期的丰度,以反应核小体的分立情况下。若该位点H3.1和H3.2上的谷氨酸标示出在一次细胞器后下降一半,所述该核小体被收容在了两个子代细胞的不常为异突变物质正当中央上;若该谷氨酸形态上慢慢地消失,所述子代细胞并未突变该突变物质正当中央的核小体。科学界首先验证了在受精骨髓当中沉默隐含的Hoxc6, Ebf1, Meis2突变物质的核小体分立情况下。这些突变物质正当中央的核小体谷氨酸水平随细胞器逐渐减半,这上会受可抑制的突变物质正当中央的核小见识被收容在子代细胞的不常为异位置。这与前人注意到的H3K9me3和H3K27me2/3可通过胚胎突变的反不常不常为印证。那么,应答标准型肝细胞地带的核小体又是如何分立的呢?科学界验证了在受精骨髓当中被应答隐含的Ccna2, Nanog和Pou5f1突变物质,注意到该突变物质正当中央的谷氨酸标示出在细胞器后呈弥散平衡状态,丰度较高,这上会对于应答标准型肝细胞地带来说,互补核小体没有简单的资源分配到子代细胞不常为应的突变物质正当中央,而是随机资源分配的。更有趣的是,在诱导受精骨髓分化时,Hoxc6突变物质由可抑制转至应答,它的核小体资源分配模式也由简单的同位点资源分配改作随机资源分配。这所述互补核小体的局部资源分配,可以反映该肝细胞地带的活性平衡状态。总的来说,该科学研究通过CRISPR引导的丝氨酸谷氨酸标示出系统对,科学研究了核小体在细胞器过程当中的分式,并注意到应答与受可抑制的肝细胞地带的核小体分式的相同。值得注意的是,在基因表达的S期当中,受可抑制的肝细胞地带的粘贴要晚于应答标准型肝细胞地带。这个时间差异也加剧不常肝细胞的粘贴速率大于异肝细胞。异肝细胞不常为对较慢的粘贴加速可能保证了核小体的简单资源分配,而不常肝细胞当中的PTMs则由不常为应的主调节因子(master regulators)这样一来识别不常为应DNA序列,并招集PTMs复合物再度确立。早期中有:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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